Przy głównych trasach wjazdowych do Kraków uruchomiono tzw. strefomaty, czyli urządzenia umożliwiające wniesienie opłaty za wjazd do Strefy Czystego Transportu. To rozwiązanie skierowane do kierowców, których samochody nie spełniają obowiązujących w strefie norm emisji spalin, a którzy mimo to chcą wjechać do miasta. Strefomaty ustawiono w dziewięciu lokalizacjach – na stacjach benzynowych BP.
Możliwość płatnego wjazdu została wprowadzona jako element okresu przejściowego po konsultacjach społecznych dotyczących SCT. Opłata dotyczy wyłącznie pojazdów niespełniających norm, natomiast samochody zgodne z wymaganiami mogą poruszać się po strefie bez dodatkowych kosztów.
Zgodnie z przyjętymi zasadami, po 1 stycznia do SCT mogą wjeżdżać samochody benzynowe spełniające co najmniej normę Euro 4 lub wyprodukowane od 2005 roku oraz pojazdy z silnikiem Diesla spełniające normę Euro 6 lub wyprodukowane od 2014 roku. Pozostałe auta wymagają wniesienia opłaty.
W 2026 roku opłata wynosi 2,50 zł za każdą rozpoczętą godzinę wjazdu. Kierowcy mogą również wykupić wjazd na cały dzień – w 2026 roku kosztuje on 5 zł. W 2027 roku opłata dzienna wzrośnie do 15 zł. Dostępne są także abonamenty miesięczne. W 2026 roku ich koszt wynosi 100 zł, w 2027 roku – 250 zł, a w 2028 roku – 500 zł. Po zakończeniu okresu przejściowego możliwość płatnego wjazdu zostanie wygaszona, a do strefy będą mogły wjeżdżać wyłącznie pojazdy spełniające wymagane normy lub objęte ustawowymi wyjątkami.
